印杯機有對印刷的色數有明顯的分類，有多色、六色印杯機，采用水油不相容、表面吸附及網點構像等三大原理進行印刷。在多色套印中，以單色為單元，以一定順序依次重疊套印，最后還原于原稿的過程，稱為墨色套印順序，簡稱色序。
對印杯機色序的安排，受各種條件的支配，為獲得良好的印刷效果，一般要遵循下列基本原則：
1.根據三原色明度排列色序：暗色先印，亮色后印。
2.根據三原色油墨的明度和遮蓋力排列色序，透明度差的油墨先印，透明度強的油墨后印。
3.根據網點面積占有的多少排列色：一般網點面積小的先印，網點面積大的后印。
4.根據原稿特點排列色序：以暖調為主的圖文先印黑、青、后印品紅、黃；以冷調為主的圖文先印品紅，后印青。
5.根據機型排列色序：單色或雙色印杯機色序一般為明暗色墨相互交替。印杯機印刷色序一般為黑、品紅、青、黃或黑、青、品紅、黃。
6.根據紙張的性質排列色序：平滑、緊密的紙張先印暗色，后印亮色；而粗、松的紙張先印明亮色，后印暗色。
7.根據油墨的干性排列色序：干燥慢的油墨先印，干性快的油墨后印。
8.根據平網和實地排列色序：平網圖文先印，實地結構后印。
9.根據淺色油墨和深色油墨排列色序：深色油墨先印，淺色或專色油墨后印。
10.根據規(guī)矩套合、換色是否方便排列色序：主色或強色套合盡量在一塊或緊挨著，不能誰意分開，另外，色序必須考慮到換色方便，否則將增加輔助時間。
總之，印杯機色序的安排是很重要且復雜的問題，必須具體問題具體分析，決不能盲目從事。